Федеральная служба по надзору в сфере защиты
прав потребителей и благополучия человека


Федеральное казенное учреждение здравоохранения

Российский научно-исследовательский
противочумный институт

«Микроб»

  • Главная
  • Контакты
  • Карта сайта

Главная / Координационный научный совет по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации / Аналитический обзор

Версия для печати

Аналитический обзор

научно-исследовательских работ, выполненных к 1 января 2015 года в рамках проблем, курируемых Научным советом по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации (48.00)

Завершенные в 2014 году темы по проблемам, курируемым НС и его проблемными комиссиями, выполнялись в соответствии с основными направлениями деятельности НС, Планом научно-организационной работы НС на 2014 г., Планом основных организационных мероприятий Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека на 2014 г., основными направлениями Концепции федеральной целевой программы «Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2009–2014 годы)». Всего в рамках НС в 2014 г. выполнялось 127 тем, из них в 2014 г. завершено 47 НИР, из них 27 НИР выполнялись по отраслевым заданиям, 1 НИР – в рамках гранта РФФИ и 19 НИОКР в рамках ФЦП «Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2009–2014 годы)».

ПК 48.01. «Эпидемиологический надзор за особо опасными инфекционными болезнями».
     ● В рамках реализации методологии информатизации мониторинга и контроля административных и природно-очаговых территорий Российской Федерации в области биологической безопасности:
          - осуществлено организационное и методическое обеспечение информатизации эпидемиологического надзора за актуальными инфекционными болезнями на административных территориях Российской Федерации – Астраханская область и Республика Калмыкия (II, В РосНИПЧИ «Микроб»);
          - на основе внедрения автоматизированной информационно-аналитической системы обеспечения эпидемиологического надзора и биологической безопасности осуществлено методическое обеспечение районирования административных и природно-очаговых территорий и разработаны соответствующие подходы к информатизации эпизоотологического мониторинга на природно-очаговых территориях (I, В РосНИПЧИ «Микроб»);
          - разработаны критериальная основа, методика и алгоритм количественной оценки биологической безопасности в субъекте Российской Федерации (I, В Иркутский НИПЧИ).
     ● Реализуется перевод паспортизации природных очагов чумы на электронную основу (ГИС – паспортизация):
          - определены методы картографирования, изучения пространственной структуры поселения носителей горного суслика с использованием комплекса технологий ГИС, глобального позиционирования (GPS навигации) и дистанционного зондирования земли (I, В СтавНИПЧИ);
          - осуществлена паспортизация на электронной основе и полевое картографирование двух природных очагов чумы – Прикаспийского Северо-Западного степного и Прикаспийского песчаного (I, В РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Дана современная эпидемиологическая характеристика клещевого вирусного энцефалита (КВЭ), иксодовых клещевых боррелиозов (ИКБ) и клещевого риккетсиоза (КР) в Иркутской области и Забайкальском крае и изучена роль их возбудителей в структуре заболеваемости населения с применением молекулярно-генетических методов лабораторной диагностики. Выявлены территориальные особенности распределения показателей, демографические и социальные группы риска. На примере Забайкальского края разработана стратегия профилактики КВЭ, основанная на оценке риска инфицирования населения разных муниципальных образований. Предложен показатель риска заболевания людей. Проведена дифференциация территории Забайкальского края по степени риска заболевания людей (высокий, средний, низкий) (II,B, ИркутскНИПЧИ).
     ● Расшифрована последовательность фрагмента гена белка Е у 45 штаммов вируса КЭ, изолированных от больных людей, таежных клещей и мелких млекопитающих в Прибайкалье и Забайкалье, полного генома – у 13 штаммов; изучены их биологические и молекулярно-генетические свойства (I,А ИркутскНИПЧИ).
     ● Показано, что в клещах Ixodes persulcatus в Иркутской области обнаруживается Rickettsia tarasevichi и три патогенных для человека вида боррелий: Borrelia garinii, В. afzelii и B. miyamotoi. В Забайкальском крае установлена циркуляция риккетсий, идентичных Rickettsia raoultii. Результаты могут быть использованы в практике эпидемиологического надзора за «клещевыми» инфекциями (II,А, ИркутскНИПЧИ).
     ● Разработан порядок проведения лабораторных исследований на иерсиниозы в лабораториях территориального, регионального и федерального уровней. В исследованиях по выявлению иерсиний (возбудителей псевдотуберкулеза и кишечного иерсиниоза) некультуральным методом (real-time ПЦР) в пищевых продуктах, мелких млекопитающих в Сибири и на Дальнем Востоке показано, что результативность ПЦР в 4,9 раза превышает бактериологический анализ (II,А, ИркутскНИПЧИ).
     ● Впервые в России идентифицированы Y. mollaretti, Y. dercovieri; от больного выделена Y. pseudotuberculosis О:1а серотипа, имеющая полный остров высокой патогенности HPI при отсутствии суперантигена ypmA/С. Технологией MALDI-ToF MS идентифицированы до рода 1276 шт. Yersina spp., Y. pseudotuberculosis в 100 % до вида, Y . enterocolitica – 99,5 %. Впервые в РФ идентифицирован штамм Y. aleksiciae (II,А, ИркутскНИПЧИ).
     ● Выполнено полногеномное секвенирование 8 штаммов Y. pseudotuberculosis (О:3 и О:1b), нуклеотидные последовательности депонированы в Международную базу данных. При VNTR-типировании Y. pseudotuberculosis (60 шт.) обнаружены 29 генотипов, 18 из которых уникальны; вспышечные штаммы показали характерные кластеры для каждого «события» и отличные по территориям (I,А, ИркутскНИПЧИ).
     ● Показана роль мяса птицы как фактора передачи кишечного иерсиниоза – в смывах с тушек кур обнаружена ДНК Y. enterocoliticа (59,6 %), подтвержденная изоляцией Y. enterocoliticа 1A (11 штаммов) и Y. enterocoliticа 2/09 (1 штамм) (II,B, ИркутскНИПЧИ).
     ● При мониторинге природных и синантропных очагов туляремии в Ростовской области получены данные о трансформациях биоценотической структуры и паразитарных систем; о сезонной и многолетней динамике эпизоотической активности природных очагов туляремии с учётом степени потенциальной эпизоотической опасности фауны основных видов носителей. Определена активность природных очагов туляремии степного и пойменно-болотного типов с учетом структуры их уровней (наземно-воздушный, водный и подземный-гнездоноровый). Разработан алгоритм определения эпизоотической активности природных очагов с учетом выявления маркеров туляремийного микроба из исследованных проб носителей, переносчиков и объектов окружающей среды с группировкой данных по уровням (подсистемам) – наземный (воздушный), водный, подземный (гнездово-норовый), представленным соответствующими биоценозами. Выделены с использованием индекса эпизоотических проявлений административные районы с различной степенью активности природных очагов на их территориях (II,B, РостовНИПЧИ).
     ● Установлен видовой состав, тенденции роста численности фоновых видов носителей возбудителя туляремии в 2013 г. относительно 1996 г., определена высокая или повышенная степень потенциальной эпизоотической опасности  фауны носителей в природных очагах пойменно-болотного и степного типов. Результаты исследований использованы для  принятия управленческих решений, в том числе обеспечения мер борьбы против и туляремии и могут быть применены при осуществлении эпидемиологического надзора при туляремии (II,B, РостовНИПЧИ).
     ● Проведена сероэпидемиологическая экспертиза территории Ростовской области на КВЭ, лихорадку денге, Крымскую геморрагическую лихорадку, лихорадку Западного Нила, определено их значение в региональной инфекционной  патологии, определена эффективность использования тест-систем в эпиднадзоре, проведено эпидемиологическое районирование по степени выявления циркуляции возбудителей КВЭ и других арбовирусных инфекций. Проведено районирование территории Ростовской области по КВЭ. Результаты исследования позволили вести целенаправленный поиск антигенов возбудителей КВЭ, ЛЗН, КГЛ и провести расшифровку этиологической структуры лихорадок и менингитов. (II,B, РостовНИПЧИ)
     ● Обобщен опыт использования ГИС при массовых мероприятиях, выявлены пространственные закономерности распределения эпидемиологических угроз. Разработана структура баз геоданных, позволяющая осуществлять ввод, хранение и анализ сведений об инфекционной заболеваемости, санитарно-гигиеническом состоянии эпидемически значимых объектов (ЭЗО), результатов анализов на наличие инфекционных агентов ЭЗО, эпидемиологических рисков. Разработано и использовано в режиме реального времени ГИС-приложение с использованием Web-интерфейса «Система поддержки принятия решений на основе геоинформационных систем при санитарно-эпидемиологическом надзоре в период проведения массовых мероприятий». Определены принципы расчета совокупных и частных эпидемиологических рисков и ранжирования административных территорий по величине эпидемиологического риска при организации ММ (I,B, СтавНИПЧИ).
     ● Составлены    и опубликованы  прогнозы на 2014 год  по чуме, сибирской язве, туляремии, бруцеллезу, холере, ЛЗН, КГЛ, клещевому энцефалиту (II,B, РосНИПЧИ «Микроб», ИркутскНИПЧИ, РостНИПЧИ, СтавНИПЧИ, ВолгоградНИПЧИ, ПЧЦ).
     ● Изданы монографии: «Санитарная охрана территории Российской Федерации в современных условиях»,  «Специализированные противоэпидемические бригады (СПЭБ): эволюция научной концепции и практического применения

ПК 48.02 «Диагностика, профилактика и лечение особо опасных инфекционных болезней»
     ● Изучена вариабельность геномов B. mallei и B. pseudomallei в  условиях культивирования in vitro и экспериментальной инфекции, разработаны способы выявления информативных участков их геномов и выбраны наиболее эффективные методы генетического типирования штаммов патогенных буркхольдерий, получены новые селективные среды для  выявления возбудителей сапа и мелиоидоза. На основе принципов полифазной таксономии разработан алгоритм идентификации и типирования патогенных буркхольдерий. Сконструированы экспериментальные серии амплификационных тест-систем для идентификации возбудителей сапа и мелиоидоза в формате ПЦР в режиме реального времени. Разработаны пакет нормативной документации на тест-системы и методические рекомендации «Использование преципитирующих моноклональных антител  к гликопротеину 200 kDa возбудителя мелиоидоза в реакции иммунодиффузии в геле для обнаружения данного антигена в различных объектах исследования» для дифференциации буркхольдерий (учрежденческий уровень внедрения). Получен патент на способ дифференциации B. mallei и B. pseudomallei.  Зарегистрированы в ФИПС 3 заявки на изобретение «Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд для идентификации Burkholderia mallei», «Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд для идентификации Burkholderia pseudomallei», «Набор флуоресцентно-меченых олигонуклеотидных зондов для типирования штаммов Burkholderia mallei методом амплификации дифференцирующих фрагментов ДНК». Полученные результаты могут быть использованы в микробиологической практике для идентификации и типирования патогенных буркхольдерий (II,B, ФКУЗ ВолгоградНИПЧИ).
     ● Разработаны отечественные латексные препараты для серологической диагностики гепатита С иммуносуспензионными методами. Получена высокоспецифичная поликлональная кроличья сыворотка к штамму гепатита С (Д-1). Синтезированы цветные латексы с заданными свойствами, пригодными для сенсибилизации антигенами вируса гепатита С и специфическими антителами. Получены латексные гепатита С антигенный и иммуноглобулиновый диагностикумы. Изучены их операционные характеристики (аналитические и диагностические). Получен патент на изобретение. Результаты могут быть применены для выявления вируса гепатита С и антител к нему в сыворотках крови больных и подозрительных на заболевание людей при скрининговых серологических исследованиях, а так же для научно-исследовательской работы в лабораториях, изучающих биологические свойства вирусов (II,B, ФКУЗ РостНИПЧИ).
     ● Разработаны полимерные интерфероновые препараты для определения концентрации лечебных рекомбинантных α-интерферонов в сыворотках больных в процессе интерферонотерапии и антител к ним. Получены гипериммунные кроличьи сыворотки к коммерческим препаратам рекомбинантного α-интерферона – «Реаферону», «Альтевиру», а также к человеческому лейкоцитарному эндогенному α-интерферону, с последующим выделением из них специфических иммуноглобулинов. Синтезированы полиакролеиновые микросферы размером 1,2±0,1 микрон, подобраны условия иммобилизации иммуноглобулинов на полимерном носителе. Получены лабораторные серии препаратов, исследована их специфическая чувствительность и специфичность. Разработанные препараты возможно применять в практическом здравоохранении при мониторинге лечения вирусных инфекций (II,B, ФКУЗ РостНИПЧИ).
     ● Разработана питательная среда,  позволяющая более точно, чем используемые в настоящее время среды, определять степень антибиотикочувствительности легионелл за счет отсутствия в ней сильно адсорбирующего агента - активированного угля. По чувствительности и ростовым свойствам Б-2 не уступает используемым средам, при определении антибиотикочувствительности легионелл обеспечивает точные результаты. Подготовлена заявка на патент. Разработана методическая документация (ТУ и инструкция по применению разработанной среды). Полученные результаты возможно использовать при лечении и профилактике легионеллеза (II,B, ФКУЗ РостНИПЧИ).
     ● Издана монография «Биосенсорные технологии в диагностике инфекционных болезней». Изготовлен и проведены межлабораторные испытания опытного образца оптического модуля индикации, внесены изменения в конструкторскую документацию к нему. Оценена эффективность обнаружения антигенов возбудителей особо опасных инфекционных болезней (чумы, сибирской язвы, туляремии, бруцеллеза) при анализе искусственно контаминированных проб воздуха и при использовании селективного концентрирования с помощью специфических магноиммуносорбентов (II, B, ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Проведена оптимизация системы внешнего контроля качества (ВКК) специфической индикации возбудителей особо опасных инфекционных болезней и разработан проект методических указаний «Порядок организации и проведения внешнего контроля качества индикации патогенных биологических агентов». Переработано практическое руководство «Специфическая индикация патогенных биологических агентов» в соответствие со структурой трехуровневой системы мониторинга и лабораторной диагностики инфекционных болезней, современных диагностических технологий и требований биологической безопасности, подготовлена к изданию новая редакция. Подготовлен к изданию сборник нормативно-методических документов по порядку организации и проведения лабораторной диагностики особо опасных инфекционных болезней в рамках единой трехуровневой системы (II,В, ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Зарегистрирован «Набор реагентов для идентификации штаммов Brucella spp. методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени (Ген Brucella – идентификация – РГФ)», который позволяет выявлять бруцеллы в биологическом материале и объектах внешней среды с одновременным определением их принадлежности к видам B. abortus/B. ovis; B. melitensis; B. suis/B.canis; B.neotomae. Препарат характеризуется высокими диагностическими показателями: аналитическая чувствительность - не менее 1×104 м.к./мл, аналитическая специфичность – 100 % (не дает положительных результатов с ДНК микроорганизмов других родов).  По данным клинических испытаний диагностическая чувствительность тест системы - не менее  98,5 % с доверительной  вероятностью 90 %  при исследовании 228 положительных образцов, содержащих B. abortus/B. ovis; B. melitensis; B. suis/B.canis; B.neotomae , а диагностическая специфичность – не менее  99 % с доверительной  вероятностью  90% при исследовании 228 положительных образцов, содержащих ДНК бруцелл и 64 отрицательных образцов, содержащих ДНК гетерологичных микроорганизмов (II,В, ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб»).

ПК 48.03 «Биомедицинские аспекты изучения особо опасных и других инфекционных болезней»
    
● Проведено полногеномное секвенирование 15 штаммов возбудителя чумы. Всего секвенировано 38 штаммов Yersinia pestis из всех природных очагов чумы в Российской Федерации, большинства очагов стран СНГ (Казахстан, Киргизия, Таджикистан, Узбекистан, Туркмения), части очагов Монголии. Определены геноварианты штаммов Yersinia pestis из этих очагов. Внесены предложения по изменению существующей подвидовой систематики возбудителя чумы (I,AB, РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Усовершенствованы системы молекулярной идентификации и алгоритм типирования возбудителей чумы, сибирской язвы, бруцеллеза, туляремии, сапа, мелиоидоза, гистоплазмоза на основе фрагментного и полногеномного секвенирования, SNP анализа, мультилокусного VNTR, метода МАЛДИ (II, АB, РосНИПЧИ «Микроб», РостНИПЧИ, ВолгоградНИПЧИ, ИркутскНИПЧИ, СтавНИПЧИ).
     ● Ведутся исследования по изучению основ сложной экологии возбудителей опасных инфекций. Определены систематическая принадлежность и численность членов почвенных биоценозов – простейших и нематод в очагах чумы Прикаспия. Получены экспериментальные доказательства возможности сохранения возбудителя чумы в клетках амеб и участия в распространении биопленок Y.pestis почвенных нематод (I, AB, РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Проведен  комплексный анализ иммунобиологических свойств поверхностных структур возбудителей особо опасных инфекций в условиях in vivo и in vitro,  в том числе на фоне применения иммуномодуляторов, как основы для совершенствования схем специфической, экстренной  иммунопрофилактики и лечения чумы, туляремии, мелиоидоза, гриппа (II,AB, РосНИПЧИ «Микроб», ИркутскНИПЧИ, ВолгоградНИПЧИ, ГНЦ ВБ «ВЕКТОР»).
     ● Разработана стратегия клонирования детерминант иммуногенности возбудителей чумы и сибирской язвы, и сконструированы биологически безопасные продуценты V-антигена чумного микроба и субъединицы летального токсина сибиреязвенного микроба (II,B, РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Усовершенствованы методы получения и изучения поверхностных антигенов, в том числе с применением достижений нанотехнологии. Сформированы панели сывороток для последующего поиска иммунодоминантных антигенов возбудителей сибирской язвы и туляремии  (II,B, РосНИПЧИ «Микроб», ВолгоградНИПЧИ, РостНИПЧИ, ИркутскНИПЧИ).
     ● Предложены новые подходы к дифференциации острого и хронического бруцеллеза, полученные  на основе анализа данных о взаимосвязи степени аллергизации организма возбудителем бруцеллеза и изменениями в иммунном статусе больных бруцеллезом (II,B, СтавНИПЧИ).
     ● В рамках изучения патогенеза и иммуногенеза туляремийной инфекции установлено, что для формирования протективного иммунитета необходим ЛПС с сохраненной О-полисахаридной цепью, представляемой только живыми бактериями. Установлено, что лечение туляремии у животных 1 группы чувствительности (белые мыши, морские свинки) аминогликозидами, фторхинолонами и рифампицином препятствует формированию иммунитета. Получена панель противотуляремийных сывороток от разных хозяев против вирулентных и авирулентных штаммов. Основным индуктором специфических антител является ЛПС, а индуктором клеточного звена - белковые антигены  (II, AB, РостНИПЧИ «Микроб»).
     ● Получены штаммы Bacillus anthracis, отличающиеся по наличию плазмид вирулентности:  одноплазмидные капсулосодержащие, одноплазмидные токсинпродуцирующие  и бесплазмидные штаммы. В качестве штамма продуцента белка ЕА1 выбран бесплазмидный штамм B. anthracis. Разработаны условия накопления белков S-слоя с использованием препаративного электрофореза, изучено иммунодиагностическое значение белка ЕА1 (III,B, ВолгоградНИПЧИ).

ПК 48.04 «Холера и патогенные для человека вибрионы»
    
● Проведена оценка динамики заболеваемости холерой в мире с использованием проблемно-ориентированной базы данных «Холера Эль Тор. Эпидемиологический анализ заболеваемости в мире». Показано, что эпидемиологическая обстановка по холере в Российской Федерации остается нестабильной (II,B, РостНИПЧИ).
     ● Проведен ретроспективный и оперативный анализ эпидемических проявлений холеры в России с учетом типов административных территорий и оценкой показателей и данных, характеризующих интенсивность и другие параметры эпидемического процесса (II,B, РостНИПЧИ).
     ● Внедрена новая технология индикации и  расширенного изучения  штаммов основанная на применение MALDI-TOF масс-спектрометрии (II,B, РостНИПЧИ, ИркутскНИПЧИ, ВолгоградНИПЧИ).
     ● Исследована структура генома новых вариантов возбудителя холеры Эль Тор, выделенных на территории России, на основе полногеномного и фрагментарного секвенирования. Установлены филогенетические связи изолированных в России штаммов. Выявлены закономерности изменения вирулентных и адаптивных свойств возбудителя в современный период текущей пандемии (II,B, РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Разработаны новые диагностические препараты для выявления новых вариантов возбудителя холеры (II,B, РосНИПЧИ «Микроб», СтавНИПЧИ).

ПК 48.05 «Биологическая безопасность и противодействие биотерроризму»
    
● Систематизирована терминологическая база, отвечающая концепции широкого формата биологической безопасности.  Разработаны предложения по формированию законодательных основ биологической безопасности (II,B, РосНИПЧИ «Микроб»).
     ● Осуществлено информационное обеспечение многоуровневой структуры функциональных элементов мониторинга и контроля чрезвычайных ситуаций биологического (санитарно-эпидемиологического) характера, являющейся методической основой для межведомственного взаимодействия (II,B, все институты).
     ● Разработаны проекты методических указаний «Методы оценки эффективности фильтров вентиляционных систем и боксов микробиологической безопасности учреждений медико-биологического профиля, осуществляющих деятельность с использованием ПБА» (II,B, РосНИПЧИ «Микроб», ПЧЦ,  ГНЦ ВБ «Вектор», ВолгоградНИПЧИ, ГНЦ ПМБ, ИркутскНИПЧИ); Методических рекомендаций «Анализ аварийности при работе с патогенными биологическими агентами» (II,B, РосНИПЧИ «Микроб», ВолгоградНИПЧИ, РостовНИПЧИ, ГНЦ ПМБ, СтавНИПЧИ, ИркутскНИПЧИ).

 

© Федеральное казенное учреждение здравоохранения Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», 2010 г.

Разработка и продвижение сайта: «Креатив Медиа»

Адрес: 410005, г.Саратов,
ул. Университетская, д.46

Тел.: +7 (8452) 26-21-31

Эл. почта: rusrapi@microbe.ru